商铺有土地使用证的作用是：
(一)可以有效保护不动产产权的完整性。
《房地产管理法》第五十九条规定：国家实行土地使用权和房屋所有权登记发证制度。
(二)可以保证房产转让中涉及的土地使用权的法律效力。
《物权法》第九条规定：不动产物权的设立、变更、转让和消灭，经依法登记，发生效力；未经登记，不发生效力。
(三)可以有效体现房地产的实际价值。
按照《物权法》第一百四十九条规定：住宅建设用地使用权期间届满的，自动续期。
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